Fonctionnement d'un virus,

2) comment il infecte sa cible ?

VIRUS BIOLOGIQUE

 Contrairement à la plupart des bactéries ou des protozoaires, les virus ne sont pas des organismes autonomes car il ne possède pas de ribosomes assurant leur reproduction. Ce sont des parasites qui dépendent de la cellule qu'ils infectent pour se répliquer. Ils détournent et perturbent le fonctionnement de la cellule en modifiant son information génétique afin que la cellule conçoit des virus. Les virus sont donc dépendants du métabolisme d'une cellule pour survivre, il est alors difficile de les éliminer sans tuer la cellule hôte.

Le type de relations qui s'installe entre virus et cellule dépend de la nature du virus. Des virus d'espèces différentes sont susceptibles d'utiliser des stratégies de réplication distinctes pour se multiplier dans un même type de cellule. Par exemple pour la réplication du génome du virus, le virus à ARN devra solliciter l'ARN polymérase de la cellule. De la même manière la cellule à ADN devra solliciter l'ADN polymérase de la cellule.

La vitesse de réplication d'un virus dans une cellule peut être très variable. Par exemple, un premier virus peut effectuer un cycle de réplication complet de l'attachement à la sortie des virions néoformés en moins de 6 heures. A l'inverse, un second virus nécessite plusieurs jours pour effectuer un cycle viral complet.

- L'infection peut être abortive si le génome viral, après avoir été introduit dans la cellule ne peut s'y répliquer (par exemple l'absence d'un facteur spécifique) ou si la réaction cellulaire est précoce et prévient ainsi la réplication du virus empêchant la survie du virus.

- Lorsque l'infection d'une cellule aboutit à la production de virus infectieux, on parle d'infection productive :

Cette infection peut être persistante lorsque la cellule survit pendant l'infection et produit du virus sans être lysée. On suspecte de plus l'existence de mécanismes alternatifs non-lytiques tel que le passage direct de cellule à cellule par le biais de synapse. Ce mécanisme s'appelle l'exocytose

- Dans la plupart des cas, les virus non-enveloppés et certains virus enveloppés entraînent la destruction de la cellule infectée. On parle alors d'infection lytique. Dans ce cas, la lyse cellulaire assure le relargage des virions dans le milieu extracellulaire, permettant alors l'infection des cellules voisines.

L'effet le plus critique de l'infection d'une cellule est probablement la modification de sa capacité codante du fait de la présence du génome viral. Celui-ci codera une série de protéines nécessaires au cycle de réplication du virus et donc à l'élaboration du virion. Les protéines ont aussi pour rôle de modifier le fonctionnement de la cellule au profit du virus, par exemple certains virus accélèrent la progression du cycle cellulaire vers la phase S de manière à pouvoir exploiter les enzymes produites au cours de cette phase pour assurer la réplication de leur propre génome. Une conséquence de cette activité est que ces protéines ont souvent pour effet de favoriser la mitose avec pour conséquence la possibilité de provoquer l'immortalisation et la transformation cellulaire. Ceci ne survient cependant qu'en cas d'échec du cycle lytique.

Les différentes étapes de l'infection virale sont les suivantes :

1 - L'attachement

Cette étape survient lors du contact entre le virus et la cellule qu'il s'apprête à infecter. Le virus grâce à sa capside va se fixer aux récepteurs situés à la surface de la cellule cible.

2 - Pénétration et Décapsidation

Deux cas se proposent alors :

- Si le virus est nu, il pourra soit injecter directement son génome dans la cellule, soit se faire envelopper par la cellule. Il devra rendre perméable ou altérer sa capside et l'enveloppe de la cellule cible afin d'injecter son génome viral dans la cellule

- Si le virus est enveloppé, soit il y a fusion de l'enveloppe du virus et de la membrane de la cellule avant que le virion ne soit directement injecté dans la cellule, soit il y d'abord endocytose puis fusion de la membrane et de l'enveloppe, à l'intérieur même de la cellule, avant qu'une altération des membranes fusionnées ne permette au virion de se libérer.

3 - La Réplication

Une fois le génome viral libre, il baigne dans le cytoplasme de la cellule et peut soit agir immédiatement soit attendre une durée indéterminée avant de se déclencher. Lorsque le génome décide d'agir il va le faire de différentes manières selon l'acide nucléique qui le constitue

- Virus à ADN :

Pour ces virus, le génome va pénétrer l'enveloppe nucléaire afin de se greffer directement sur l'ADN de la cellule et en utiliser la machinerie pour se reproduire au cours de la mitose.

- Virus à ARN :

Une opération de transcription inverse est nécessaire afin de convertir l'ARN viral en une molécule d'ADN à double hélice, qui pourra être intégrée au génome de la cellule. Il va ensuite agir comme le virus à ADN.

En plus de sa réplication le génome viral va permettre la production des protéines formant des capsides et des enveloppes virales. Tous ces éléments vont alors pouvoir s'assembler dans la cellule pour recréer des virus complets.

4 - La Sortie

Enfin une fois multiplié et réencapsidé le virus va chercher à sortir de la cellule. Pour ce faire il peut procéder de deux manières selon s'il est enveloppé ou non :

- Si le virus est nu, il va procéder par lyse cellulaire : il va se reproduire de façon tellement anarchique que la cellule va finir par en exploser, libérant alors dans l'organisme toutes les copies du virus qu'elle aura produit.

- Si le virus est enveloppé, alors il va procéder par bourgeonnement : une protéine va former des spicules (sécrétions minérales extracellulaires) sur une partie de la membrane cellulaire et le virus va sortir de la cellule en coupant cette partie de la membrane qui lui servira de nouvelle enveloppe.

Cependant, pour infecter une personne puis une autre, les virus empruntent différentes voies. La transmission du virus d'un individu à un autre peut se faire de différentes façons :

La transmission peut se faire par voie respiratoire : les gouttelettes de sécrétions respiratoires, ou les aérosols formés lors d'éternuements sont capables de persister dans l'atmosphère et de pénétrer dans les voies respiratoires.

La transmission peut être féco-orale : la contamination buccale par un virus excrété par les selles . Cette contamination est directe via les mains (on parle de contamination manuportée), soit indirecte via certains aliments ou l'eau. Il s'agit souvent de virus nus, capables de persister dans l'environnement. Ces virus peuvent contaminer des objets tel qu'une poignée, un verre, une bouteille. Ces objets contaminés et porteurs de virus peuvent donc transmettre les infections. Par exemple les vomissures peuvent s'associer à la contamination fécale. Quand une personne avec une gastro-entérite vomit, ses vomissures s'accompagnent d'aérosols qui peuvent largement contaminer les objets environnants et donner lieu à des infections.

Les transmissions parentérales sont essentiellement de transmissions par injections avec du matériels souillés (aiguilles ou scalpels). C'est le cas des toxicomane intra veineux qui partagent leurs seringues. Les principaux virus qui infectent de cette manière sont le VIH, le virus de l'hépatite B ou de l'hépatite C

La transmission sexuelle implique un contact prolongé de muqueuse à muqueuse. Les principaux virus se transmettant par voie sexuelle sont le VIH ainsi que le virus de l'hépatite B ou de l'hépatite C.

La transmission mère enfant peut survenir :

- soit avant la naissance

- soit au cours de la grossesse

- soit autour de la naissance et être due à la présence de sang, urine et selles de la mère lors du passage de l'enfant

- soit après la naissance et est généralement liée à l'allaitement maternel.

La transmission par arthropodes (moustiques, mouches piqueuses, tiques) : Les principaux virus infectant par le biais d'arthropodes sont le paludisme, la fièvre jaune ainsi que la dengue.

On parle de zoonoses dans le cas où les virus touchent principalement les animaux mais qui peuvent dans certains cas affecter l'homme. Ces viroses constituent principalement une menace pour les hommes qui sont fréquemment en contact avec les animaux, comme les agriculteurs, les aviculteurs. 

VIRUS INFORMATIQUE

Un ordinateur qui n'est pas connecté à internet et qui n' a aucun contact avec des supports amovibles comme des clés USB ou des CD ne peut pas être infecté par un virus sauf si l'utilisateur crée et installe lui même un virus sur son ordinateur.

Il y a donc 2 moyens pour un virus d'entrer dans un ordinateur :

1) Les supports amovibles ( disquette CD ou clé USB )

si un progrmame infecté est présent dans un support amovible, quand il sera en contacte avec l'ordinateur il profitera de la fonction d'auto-execution du système d'exploitation pour se lancer automatiquement.

2) Internet (ou autre sorte de réseau "bluetooth", nfc ...)

Internet est un outil qui permet le partage de fichiers et de documents c'est donc un lieu propice pour y propager un virus. En effet aujourd'hui c'est la première source d'infection. Le navigateur traduit via des modules comme "java" ou "flash" des données fournie par un site web en instructions exécutables, pour afficher une animation par exemple. Or dans les lignes de codes nécessaires à ces animations il est facile d'y glisser un code viral. Un simple clic de l 'utilisateur sur un lien douteux éxécutera alors le virus qui pourra se propager dans tout l'ordinateur.

Les boites de messagerie sont aussi de bons moyens de propager un virus cepandant  ouvrir l'email d 'un inconnue ne comporte pas de risque, c est plutôt cliquer sur le lien écrit dans l 'email ou alors ouvrir la piece jointe qui est dangereux.

Les plateformes de discussion instantanée ( chat ) sont aussi un bon moyen de propager un virus si la plateforme n'est pas bien protégée.

Enfin lors de la mise à jour d'un logiciel ou d'un programme en plus de ce qu'on voulait télécharger il peut y avoir des fichiers de données infectés ( virus macro) ou le programme que l'on télécharge peut être lui même infecté.

Le but d'un virus est de se propager le plus possible pour effectuer les instructions de son programmeur. Certains virus après avoir infecté l'ordinateur dans lequel ils sont, vont infectés tous les supports amovibles ou envoyer des fichiers corrompus via la boite de messagerie sans que l'utilisateur ne se rende compte de rien.